رهبری طالبان در پی تعیینات در ولایت بادغیس، تنها چهار کرسی اداری را برای اقوام غیرپشتون اختصاص داده است. براساس بررسی‌ها در این ولایت، طالبان ۲۶ فرمانده‌شان را از یک قوم در رهبری واحدهای ملکی و نظامی تعیین کرده‌اند. این کرسی‌ها مقام ولایت و حدود پنج ولسوالی را شامل می‌شود. به گفته منابع، طالبان شایسته‌گی را نیز معیار کارشان قرار نداده‌اند و تنها براساس ترس از شکل‌گیری جزایر قدرت در صفوف این گروه، اقدام به این کار کرده‌اند. این در حالی است که برمبنای آمار اداره احصاییه بادغیس، ملیت‌های تاجیک و ترکمن بیش‌ترین تعداد باشنده‌گان این ولایت را تشکیل می‌دهند. گفتنی است که طالبان پیش از این نیز برخی از فرماندهان‌شان را به همین دلایل به حاشیه رانده‌اند. منابع می‌گویند که به دلیل این‌گونه تعیینات، اختلاف‌ها در میان طالبان افزایش یافته است و جنگ‌جویان غیرپشتون به گروه‌های ضد طالبان پیوسته‌اند. این در حالی است که طالبان هرازگاهی بر همه‌شمول بودن رژیم‌شان تأکید دارند.
بادغیس از ولایت‌های غربی کشور است که بیشتر ساکنان آن را به ترتیب تاجیک‌تباران، ترکمن‌تباران، پشتون‌تباران و هزاره‌تباران تشکیل می‌دهند. هم‌چنان زبان رایج در این ولایت فارسی و ترکمنی است. با این حال، منابع محلی در بادغیس می‌گویند که فرماندهان محلی طالبان نزدیک به ۹۰ درصد واحدهای ملکی و نظامی کلیدی در این ولایت را به فرماندهان پشتون‌تبار اختصاص داده‌اند. یک منبع روز شنبه، ۲۱ جوزا، به روزنامه ۸صبح گفت که براساس استخدام‌های طالبانی، در ۲۶ واحد ملکی و نظامی، به شمول شش ولسوالی، فرماندهان پشتون‌تبار تعیین شده‌اند. این در حالی است که به گفته منبع، از میان ۳۰ اداره، تنها چهار کرسی برای تاجیک‌تباران و ترکمن‌تباران اختصاص یافته است.
براساس تقسیم‌بندی طالبان، مولوی عبدالصمد جاوید والی طالبان برای بادغیس، مولوی محمدعیسی سراج رییس استخبارات، مولوی عبدالستار صابر قوماندان امنیه، مولوی عبدالقیوم پیروز قوماندان لوا، مولوی علم‌گل حقانی معاون والی، محمدآصف قانت رییس صحت عامه، مولوی بازمحمد سروری آمر اطلاعات و فرهنگ، مولوی تاج‌الدین رییس محیط زیست، مولوی عبدالرحمان رحمانی رییس فواید عامه، مولوی بارداد صابر رییس حوادث، مولوی باردید حنفی رییس دفتر مقام ولایت، محب‌الله احسان رییس معارف، محسن احسان رییس زراعت و مالداری، مولوی عبدالباری فایز آمر لوجستیک لوای ۳، ولسوال جوند، ولسوال قادس، ولسوال مقر، ولسوال غورماچ، ولسوال بالامرغاب، قوماندان امنیه بالامرغاب، قوماندان امنیه غورماچ، قوماندان امنیه مقر، آمر پاسپورت، آمر ورزش، آمر امنیت فرماندهی امنیه و آمر برق برشنا را از میان پشتون‌تباران تعیین کرده‌اند.
منابع می‌گویند که این افراد پس از تأیید کابینه طالبان، گماشته شده‌اند. به گفته یک تن از باشنده‌گان محل، هرچند برخی از جنگ‌جویان و فرماندهان تاجیک، اوزبیک، هزاره و ترکمن نقش عمده در جنگ این گروه علیه حکومت پیشین داشتند، اما به دلیل بی‌اعتمادی سران طالبان بالای اقوام غیرپشتون، کرسی‌های مهم و کلیدی به این فرماندهان سپرده نمی‌شود. این در حالی است که به گفته وی، در سال‌های اخیر و با پیش‌روی طالبان به سمت مراکز ولسوالی‌ها و شهرها، جنگ‌جویان غیرپشتون صرف به‌عنوان قربانی به خط نخست نبرد فرستاده می‌شدند. او که از جریان این تعیینات آگاه است، می‌گوید که سران طالبان پس از تحرک برخی از فرماندهان این گروه، از شکل‌گیری جزایر قدرت توسط سایر اقوام نگران شده‌اند.
هم‌چنان به گفته یک تن از فعالان در غرب کشور، بی‌اعتمادی طالبان بالای سایر اقوام سبب اختلاف در میان این گروه شده است. به گفته او، طالبان هم اکنون در تشکیل اداره‌ها تک‌قومی رفتار کرده‌اند و این کار سبب شده است و که طالبان غیرپشتون در چرخه قدرت راه نیابند. این در حالی است که به گفته او، هم اکنون برخی از طالبان غیرپشتون به دلیل بی‌تفاوتی رهبران‌شان، پرچم ضد طالبانی بلند می‌کنند و علیه این گروه می‌جنگند.
گفتنی است که پیش از این، چندین فرمانده طالبان به دلیل اختلاف‌های درونی برخاسته از تقسیمات قومی، از ترکیب این گروه کنار گذاشته شده و یا خود کنار‌ه‌گیری کرده‌اند. در این میان، طالبان مولوی مخدوم عالم ربانی، از فرماندهان اوزبیک‌تبار این گروه را به بهانه‌های مختلف زندانی کردند و به حاشیه راندند. هم‌چنان در ادامه مولوی مهدی مجاهد، یک عضو هزاره‌تبار این گروه در سرپل، نیز با شرایط مشابهی گرفتار شده است و در انزوا به سر می‌برد. در کنار این موارد، طالبان محمدآصف عظیمی تاجیک‌تبار را در سمنگان که سبب واگذاری این ولایت به طالبان شده بود، خلع سلاح کرده‌اند.
پیش از این، خبرهایی از نارضایتی اعضای طالبان نشر شده بود. به گفته منابع، برخی از فرماندهان و جنگ‌جویان طالبان از عملکرد رهبری گروه‌شان به‌شدت ناراضی‌اند و گوشه‌نشینی اختیار کرده‌اند. این در حالی است که طالبان بارها بحث تک‌قومی بودن رژیم‌شان را رد کرده و بر همه‌شمول بودن آن تأکید دارند.
